两者最主要的区别。1、参保对象及缴费依据不同。(1)职工医保不区分户口性质，只要实现就业或者是无雇工的个体工商户、灵活就业人员都可以参保，以所在用人单位的上一年度平均工资为征收依据。(2)城镇医保仅限于本辖区内的“非农业户口”人员参保，实行的是补助及参保人缴纳剩余部分的方式缴费。2、两者的享受待遇不同。(1)职工医保的只要退休前缴费达到一定的年限(如：25年)，退休后，每月医保卡会打入一定的待遇，城镇医保仅限于参保当年享受，没有退休待遇。(2)同等条件下，职工医保的缴费基数及报销比例都大于城镇医保。缴费周期不同：职工医保是按月缴费，新农保按年缴费。缴费金额不同：职工医保是按照参保人缴费基数核算月缴费额，所以个体间是有较大差异的；但新农保缴费金额是一样的。缴费主体不同。