农村合作医疗和医保的区别如下：1、缴费主体不同。医保是城镇职工缴纳的，农村合作医疗是农民缴纳的。2、费用不同。医保具有强制性，按照职工工资的一定比例收取，农村合作医疗是农民自愿参加，费用一般固定。3、缴纳方式不同。医保是单位和职工一起缴纳的，而且单位缴纳大部分，职工只缴纳小部分。农村合作医疗是农民自己缴纳的。新农合异地就医报销流程。1、患者本人/家属带患者身份证（或户口本）、两张一寸彩色照片、新农合医疗证到参合地经办机构转诊备案手续，也可以致电办理。2、携带患者身份证、新农合医疗证和转诊备案手续到转诊医院就医，办理新农合住院手续，只有要找跨省定点医疗机构就医。3、患者住院接受治疗。