合作医疗和医保有以下几点区别。1、缴费主体不同。医保是城镇职工缴纳的，农村合作医疗是农民缴纳的。2、费用不同。医保具有强制性，按照职工工资的一定比例收取，农村合作医疗是农民自愿参加，费用一般固定。3、缴纳方式不同。医保是单位和职工一起缴纳的，而且单位缴纳大部分，职工只缴纳小部分；农村合作医疗是农民自己缴纳的。合作医疗，也称为新型农村合作医疗保险，是在群众自愿的基础上，为治病防病提供帮助的福利性的医疗制度。随着试点的不断探索和深入，我国农村合作医疗保险逐渐将肺癌、胃癌等20多种疾病纳入大病保障范畴，大病住院费用实际报销比例最高可达90%。也就是说如果一个人参与了合作医疗，如果因为某种疾病住院，则不用害怕手术或者看病费用高昂。也在一定程度上缓解了“看病难，看病贵”的问题。