三档。个人所得税规定纳税人住房租金专项附加扣除标准有三档，分别为每月1500元、每月1100元以及每月800元这三个档位。个人所得税专项附加扣除的申报方式是由纳税人向办税机构自主申报。一、个人所得税规定纳税人住房租金专项附加扣除标准有几档。个人所得税规定纳税人住房租金专项附加扣除标准有三档。直辖市、省会（首府）城市、计划单列市以及确定的其他城市，扣除标准为每月1500元；除第一项所列城市以外，市辖区户籍人口超过100万的城市，扣除标准为每月1100元；市辖区户籍人口不超过100万的城市，扣除标准为每月800元。根据《个人所得税专项附加扣除暂行办法》第十七条规定，纳税人在主要工作城市没有自有住房而发生的住房租金支出，可以按照以下标准定额扣除。