公司盈利100万需要根据公司是否是小微公司来确认对应的税额，如果公司不是小微公司，则按25%来计算公司所得税，应纳税额为25万，如果公司是小微公司，则按25%计入应纳税所得额，按20%缴纳公司所得税，实际应纳税额为5万元。如果符合其他税收优惠，则按其适用税率征收。公司收入100万所缴纳的比例根据企业的具体情况而定，企业所得税税法规定如下：1、新企业所得税法规定法定税率为25%，内资企业和外资企业一致。2、国家需要重点扶持的高新技术企业为15%，小型微利企业为20%，非居民企业为20%。企业应纳所得税额=当期应纳税所得额*适用税率企业的应税所得额，需要按照税法的规定对企业的总利润进行调整，不是企业总利润直接乘以税率计算出来的。个人独资企业，不缴纳企业所得税，而是缴纳个人所得税。