网站可以申请软件著作权，但需要注意以下事项：1、网站必须是开发者开发的；2、网站必须为已固定在某种有形物体上的作品。3、网站所有人应当向著作权行政管理部门认定的软件登记机构提出书面的申请。《计算机软件保护条例》第四条法律依据：《计算机软件保护条例》第四条《计算机软件保护条例》第四条受本条例保护的软件软由开发者开发，并已固定在某种有形物体上。第五条中国公民、法人或者其他组织对其所开发的软件，不论是否发表，依照本条例享有著作权。第六条本条例对软件著作权的保护不延及开发软件所用的思想、处理过程、操作方法或者数学概念等。第七条软件著作权人可以向著作权行政管理部门认定的软件登记机构办理登记。软件登记机构发放的登记证明文件是登记事项的初步证明。办理软件登记应当缴纳费用