要扣掉薪资的。生育保险一般包括：生育津贴+一次性分娩营养补助费+生育费用构成本来产假期间的薪资（也就是生育津贴）是由社保机构的生育保险支付的。但是一般为照顾产妇期间的生活，公司先照常发放薪资。所以当你报完生育保险后，生育津贴公司一般会扣留下来，剩下的费用都全部发放给职工。法律依据。《中华人民共和国人口与计划生育法》 第二十五条 符合法律、法规规章生育子女的夫妻，可以获得延长生育假的奖励或者其他福利待遇。《女职工劳动保护特别规章》 第七条 女职工生育享受98天产假，其中产前可以休假15天；难产的，应增加产假15天；生育多胞胎的，每多生育1个婴儿，可增加产假15天。女职工怀孕未满4个月流产的，享受15天产假；怀孕满4个月流产的，享受42天产假。《中华人民共和国社会保险法》。