农村宅基地归农业农村部门、国土资源管理局管理，由乡镇负责审核批准。根据最新土地管理法中的相关规定，农业部拥有宅基地管理和执法权，负责完善宅基地用地标准等等；国土资源局统筹安排宅基地的规模和布局等等。一、农耕用地可以盖厂房吗。可以，但要经过申请。(一)经营者申请。设施农业经营者应拟定设施建设方案，方案内容包括项目名称、建设地点、用地面积，拟建设施类型、数量、标准和用地规模等；并与有关农村集体经济组织协商土地使用年限、土地用途、补充耕地、土地复垦、交还和违约责任等有关土地使用条件。协商一致后，双方签订用地协议。经营者持设施建设方案、用地协议向乡镇提出用地申请。