三方协议的有效期限是三年。三方协议是《全国普通高等学校毕业生就业协议书》的简称，它是明确毕业生、用人单位、学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的书面表现形式，能解决应届毕业生户籍、档案、保险、公积金等一系列相关问题。协议在毕业生到单位报到时签订、用人单位正式接收后自行终止。三方协议的意义；1、三方协议作为国家统计大学生就业率的一个根据，同时也是国家派遣证发放的一个证明。只有毕业生签署了三方协议，拿回学校，学校才会在毕业后将派遣证发给该生，拿着派遣证到毕业生工作的单位报到，就此开始计算工龄。