公司不能克扣员工工资。但是用人单位可以代扣劳动者工资，如：用人单位代扣代缴的个人所得税；用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用等。一、在试用期工资不低于合同工资的多少。试用期工资不低于劳动合同工资的百分之八十，并不得低于用人单位所在地的最低工资标准。用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；用人单位代扣代缴的个人所得税；其他。二、绩效考核扣底薪合法吗。