公司合并后的税务事项的处理方式是，公司需要清算合并所得的财产，用企业的收入总额，减去不征税收入、免税收入、各项扣除以及弥补亏损的余额，来计算企业所得税的应纳税额。【法律依据】；《中华人民共和国企业所得税法》第四条。企业所得税的税率为25％。非居民企业取得本法第三条第三款规定的所得，适用税率为20％。第五条；企业每一纳税年度的收入总额，减除不征税收入、免税收入、各项扣除以及允许弥补的以前年度亏损后的余额，为应纳税所得额。第六条；企业以货币形式和非货币形式从各种来源取得的收入，为收入总额。包括。（一）销售货物收入。（二）提供劳务收入。（三）转让财产收入。（四）股息、红利等权益性投资收益。（五）利息收入。（六）租金收入。（七）特许权使用费收入。（八）接受捐赠收入。（九）其他收入。