农村合作医疗报销比例是：村卫生室及村中心卫生室就诊报销60%，镇卫生院就诊报销40%等；农村医保住院报销比例：镇卫生院报销60%，二级医院报销40%，三级医院报销30%。一、门诊补偿；1、村卫生室及村中心卫生室就诊报销60%，每次就诊处方药费限额10元，卫生院医生临时补液处方药费限额50元。2、镇卫生院就诊报销40%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额100元。3、二级医院就诊报销30%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。4、三级医院就诊报销20%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。5、中药发票附上处方每贴限额1元。6、镇级合作医疗门诊补偿年限额5000元。二、住院补偿；