视情况而定。1、如果公司在与劳动者签订劳动合同时约定了具体的绩效工资标准，那么公司通过绩效考核来扣除绩效资是合理合法的。2、如果合同中没有约定，那怎么扣都是违法的。绩效考核制度的制定如下：1、如果劳动者的工资结构中包含绩效工资，必须是双方约定一致的，公司是不能单方面从原有的固定工资中拆分出一部分作为绩效工资。2、绩效考核的具体考核内容必须合理合法的，这包括考核的指标、标准、结果及相对应的绩效工资浮动机制等内容。3、绩效考核制度必须要经过民主制定程序及公示，并厦行了告知员工的义务。绩效考核制度的原则如下：1、公平原则；公平是确立和推行人员考绩制度的前提。不公平，就不可能发挥考绩应有的作用。2、严格原则；