商品房内部认购书是否合法要视情况而定，具体如下：1、商品房预售实行许可制度，开发企业进行商品房预售，应当向房地产管理部门申请预售许可，取得《商品房预售许可证》。2、未取得《商品房预售许可证》的，不得进行商品房预售，在这种情况下，房子内部预购是不合法的。商品房预售许可依下列程序办理。1、受理。开发企业按本办法第七条的规定提交有关材料，材料齐全的，房地产管理部门应当当场出具受理通知书；材料不齐的，应当当场或者5日内一次性书面告知需要补充的材料。2、审核。房地产管理部门对开发企业提供的有关材料是否符合法定条件进行审核。开发企业对所提交材料实质内容的真实性负责。