企业被收购债务会由合并后的公司继承。企业被收购的时候双方会签订一份达成一致意见的协议，以确定债权债务的具体情况。同时收购公司也可以和债权人进行协商，要求降低债务的数额，或者是减免部分债务。被收购企业在进行清算的时候，要把债务转移的事项通知到债权人，并且应当在报纸上发布相关的公告。一、签署协议及手续事项是什么。收购双方及目标公司债权人代表组成小组，草拟并通过收购实施预案。债权人与被收购方达成债务重组协议，约定收购后的债务偿还事宜。收购双方正式谈判，协商签订收购合同。