个人独资企业和合资企业在投资主体、经营方式、利润分配、投资人数和责任承担等方面存在差异。个人独资企业由个人投资经营，自负盈亏，责任无限。合资企业由两个或两个以上的投资主体合作经营，按出资比例分享成果，共同承担风险，责任连带无限。法律分析；1、投资主体不同：个人独资企业：指有一个投资主体并且是个人出资，按照有关规定在工商行政部门登记注册开办的企业。合资企业：指有两个或两个以上的投资主体共同出资，按照有关规定在工商行政部门登记注册开办的企业。2、经营方式不同：个人独资企业：是一个人投资经营。合资企业是两个或两个以上的投资主体合作经营.3、利润分配形式不同：个人独资企业是投资者个人自主经营，自负盈亏。合资企业投资者（两个或两个以上的人）共同经营，按出资比例，分享成果，共担风险。