劳动合同未签订补偿协议的处理方式：当事人可协商补偿，协商不成可申请调解、仲裁，对仲裁裁决不服可提起诉讼。法律依据为《劳动争议调解仲裁法》第五条。劳动合同保密协议的签订方式：遵循公平原则，明确保密范围，约定保守用人单位商业秘密的事项。法律分析；一、劳动合同未签订补偿协议该如何补偿。1、发生劳动争议案件，用人单位和劳动者可以协商补偿；协商不成的，向基层人民调解组织、企业劳动争议调解委员会或在乡镇、街道设立的具有劳动争议调解职能的组织申请调解；调解不成，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服，向人民提起诉讼。