合作医疗的报销规定：参保患者在区内乡镇级医疗机构可直接刷卡报销，市内定点医院住院结算时也可刷卡报销。参保患者在市外医院住院后三个月内，需携带医药费用原始和明细清单到行政服务中心报销。根据《社会保险法》，职工和个体工商户等灵活就业人员应参加基本医疗保险，并按规定缴纳保险费。法律分析；合作医疗的报销：参保患者须凭本人医疗卡、本人有效身份证，经确认身份后，在区内乡镇级普通门诊定点医疗机构可直接刷卡报销，在区内及区外市内定点医疗机构住院，出院结帐时直接刷卡报销。在市外二级及二级以上公立医疗机构医院住院治疗的参保患者，应在出院后三个月内，由参保人或其家属带医药费用原始、住院医药费用汇总明细清单等到县区行政服务中心一楼新农合窗口报销医药费用。法律客观。