已经分居两年离婚可以通过以下证据证明。1、一方在外居住的房屋租赁合同。2、双方签订的夫妻分居书面协议。3、居委会（或物业）居住证明，水、电、煤气等。4、能证明双方感情不和分居事实的双方来往的书信、电子邮件等。5、双方已经分居的证人证言，比如双方都认识的朋友，亲戚或邻居的证人证言。【本文关联的相关法律依据】。《民法典》第一千零七十九条。夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民提起离婚诉讼。人民审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚。（一）重婚或者与他人同居。（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员。（三）有、吸毒等恶习屡教不改。（四）因感情不和分居满二年。