企业清理欠款时应该注意的事项：欠款都需要有借据、收据、欠条等债权凭证来予以证明；偿还欠款的诉讼时效是三年；以及债权人只能通过协商、诉讼等合法的方式来实现其债权。【法律依据】；《最高人民关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》第二条。出借人向人民提起民间借贷诉讼时，应当提供借据、收据、欠条等债权凭证以及其他能够证明借贷法律关系存在的证据。当事人持有的借据、收据、欠条等债权凭证没有载明债权人，持有债权凭证的当事人提起民间借贷诉讼的，人民应予受理。被告对原告的债权人资格提出有事实依据的抗辩，人民经审查认为原告不具有债权人资格的，裁定驳回起诉。《民法典》第一百八十。向人民请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。