企业在清理欠款的时候应该注意的事项为：欠款都需要有借据、收据、欠条等债权凭证来予以证明；偿还欠款的诉讼时效是三年；以及债权人只能通过协商、诉讼等合法的方式来实现其债权。一、民间借贷债权人的合法权益怎么维护。民间借贷中债权人可以通过审查借款人的信用状况和还款能力、保存借据、收据、欠条等债权凭证以及其他能够证明借贷法律关系存在的证据、注意诉讼时效等方式维护其合法权益。根据《最高人民关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》第二条规定，出借人向人民提起民间借贷诉讼时，应当提供借据、收据、欠条等债权凭证以及其他能够证明借贷法律关系存在的证据。