三方协议与劳动合同的区别是，三方协议的主体是学校、毕业生与用人单位，而劳动合同的主体是劳动者与用人单位。并且三方协议是学生在校期间签订的，而劳动合同可以是离校后签订的。一、就业协议书的法律性质是什么。就业协议书的法律性质是：民事合同说民事合同说认为就业协议作为明确毕业生、用人单位和学校在毕业生就业过程中发生的权利和义务的书面表现形式，是在毕业生、用人单位和高校在互利的基础上通过自主选择、自愿协商而达成的。就业协议书即“三方协议”，全称是《全国普通高等学校毕业生就业协议书》，是为明确毕业生、用人单位、毕业生所在学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务，经协商签定的协议，也是学校派遣毕业生的依据。在学生毕业离校前，学校将根据协议书的内容开具毕业生就业报到证和户口迁移证，同时转递学生档案等。