事业单位除名争议应按除名争议处理，工龄计算应一致。根据劳办发(1995)104号文件，除名职工的连续工龄应从个人缴纳养老保险费的时间开始计算。工龄反映了职工对社会和企业的贡献，对于因违反劳动纪律被除名或自动离职的职工，工龄计算办法应统一。如果没有受过开除处分，被除名前的工龄可以和重新就业后的工作时间合并计算。如果受过开除处分，连续工龄只能从受处分或刑满释放后重新计算。法律分析；事业单位因自动离职处理发生的争议应按除名争议处理。