如果个体户核定征收开票超出核定征收额，企业需要首先向主管税务机关申请核定税款的具体情况，并准备相关证明材料，比如出票原始凭证或税款核定书。如果税务机关认定超出的税款是正确的，企业应及时缴纳多缴的税款，并按次月20日前向主管税务机关申报上一期纳税申报表申报机构，同时申请减免税额。法律依据。《个体工商户税收定期定额征收管理办法》。第十规定，定期定额户当期发生的经营额、所得额超过定额一定幅度的，应当在法律、行规规定的申报期限内向税务机关进行申报并缴清税款。