员工怀孕期间产检是不会扣工资的，《女职工劳动保护特别规定》第六条第三款明确规定：怀孕女职工在劳动时间内进行产前检查，所需时间计入劳动时间。为了加强对孕期女职工的保护，《特别规定》还明。确要求对女职工在孕期不能适应原工作的，用人单位应当根据医疗机构的证明，予以减轻劳动量或者安排其他能够适应的劳动。对怀孕7个月以上的女职工，用人单。位不得延长劳动时间或者安排夜班劳动，并应当在劳动时间内安排一定的休息时间。也就是说，对女职工产前检查，用人单位应按劳动者正常出勤对待，所需时间计入劳动时间，不得按病假、事假处理。一、公司能辞退孕妇吗。公司不能辞退怀孕的员工，劳动者有下列情形之一的，用人单位不得依照法律规定解除劳动合同。