个人申请退个人所得税的程序是向所管辖的基层分局提出申请，填写《退税申请审批表》并提供相关资料，经过审核、签署意见、审批等程序后办理退税手续。个人可以扣除按规定缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费和失业保险费。对于多缴纳的个人所得税，可以向主管税务机关申请退还。申请退税所需材料包括完税凭证、个人所得税明细申报表、退税申请表、工资发放单等，并需提供真实、可靠、完整的材料。法律分析；一、个人如何申请退个人所得税。1、凡按规定需要经审批的五项提退，由纳税人向所管辖的基层分局提出申请，填写《退税申请审批表》并提供有关资料，分局管理科审核纳税人的有关退税资料，转分签署意见后报县局征收计会科，再报分管审批。