卫生许可证在卫生行政部门办理，有卫生行政部门发放卫生许可证。我国法律规章，卫生行政部门发放卫生许可证，必须严格按照法律、法规和规章规章的权限、范围、条件与程序，遵循公开、公平、公正、便民原则。，具体办理过程如下：1、申报：申请单位提出书面申请，填写《卫生许可证申请书》或《卫生许可证变更申请书》并递交符合卫生要求有关材料(材料要求见后)。2、登记：依照卫生许可受理规章和公共场所许可的条件，对属于受理范围的申报材料进行核对、登记。新建、改建、扩建公共场所应按照预防性卫生监督工作程序，先办理建设项目卫生审查认可，按审核批准的内容施工，工程竣工后申办建设项目竣工卫生验收认可，再申报办理《公共场所卫生许可证》。第三条 地方卫生行政部门遵守本办法，对食品生产经营者发放卫生许可证