专利保护与商业秘密保护制度有如下不同：1、申请专利权要按照一定的法定程序，且需要公开，而商业秘密则一般不予公开；2、保护范围不同。专利保护范围以当事人提交的申请材料为准，而商业秘密则根据其秘密性、价值性、竞争性、地域性、时效性等方面综合进行确认。3、专利保护与商业秘密保护制度的其他不同之处。《反不当竞争法》第九条法律依据：《反不当竞争法》第九条《反不当竞争法》第九条经营者不得实施下列侵犯商业秘密的行为：（一）以盗窃、贿赂、欺诈、胁迫、电子侵入或者其他不正当手段获取权利人的商业秘密；（二）披露、使用或者允许他人使用以前项手段获取的权利人的商业秘密。2021年6月1日生效的《专利法》第六十四条发明或者实用新型专利权的保护范围以其权利要求的内容为准，说明书及附图可以用于解释权利要求的内容