宅基地确权超出的面积处理方法如下：1、由政府处理；宅基地确权超面积的处理必须由政府负责，政府将作出确权决定。2、法院管辖权限；法院对宅基地侵权纠纷有管辖权，但对宅基地确权纠纷没有直接管辖权。3、申请处理；当事人可向当地乡（镇）政府或土地管理所等受理机关提出处理申请。4、复议与诉讼；不服处理决定的当事人可在规定时间内向上级机关申请复议，或在复议决定后向人民法院提起诉讼。宅基地确权超出面积的法律后果。1、超出部分不予确权：对于超出规定面积的宅基地，超出的部分一般不予确权。2、必须返还土地：如果超出的部分违反了土地管理法的规定，当事人可能需要返还超出部分的土地。3、可能面临罚款：根据土地管理法的相关规定，超出宅基地面积的行为可能会受到行政处罚，包括罚款。