法律分析：（一）犯罪主体不同：以危险方法危害公共安全罪从刑法中的规定来看，其犯罪主体为一般主体，即年满16周岁，精神正常的自然人。妨害传染病防治罪的犯罪主体则为一般主体，包括自然人和单位，其主体范围比前罪更宽泛。（二）犯罪客体不同：以危险方法危害公共安全罪的犯罪客体是国家对社会公共安全的管理秩序，这里的公共安全是指不特定多数人的生命、健康和重大公私财产安全。妨害传染病防治罪的犯罪客体是国家关于传染病防治的管理秩序。