5万年终奖需要扣税4790元。居民个人取得的全年一次性奖金可以选择单独计算纳税。计算方法为奖金收入除以12个月，按月度税率表确定适用税率和速算扣除数。5万元年终奖按此方法计算，应纳税额为奖金收入乘以适用税率减去速算扣除数，即4790元。自2022年1月1日起，全年一次性奖金应并入当年综合所得计算缴纳个人所得税。2022年1月1日之后领取的年终奖，需按并入综合所得的方式计算税额。年终奖的税率表。1、不超过3，000元的部分，税率为3%。2、超过3，000元至12，000元的部分，税率为10%。3、超过12，000元至25，000元的部分，税率为20%。4、超过25，000元至35，000元的部分，税率为25%。5、超过35，000元至55，000元的部分，税率为30%。