两者适用的情形、两者确立的法条依据、两者制度设计的目的、两者适用的宽严程度、结案后是否继续查控财产不同。1、两者适用的情形不同。根据《执行立结案规定》17条，适用终结执行有13种情形。根据民诉解释519条，终本适用只有一种情形：被执行人确实无财产可供执行。2、两者确立的法条依据不同。终结执行为民诉法257条所确立，终-本为民诉解释519条所创设。在使用时，”终本“二字有固定的涵义，特指是终结本次执行程序的简称，而”终结执行“四字也有特定的涵义，两者使用时不要相混淆。3、两者制度设计的目的不同。终结执行是因为正在进行的执行程序出现了不可能或没有必要继续进行的法定事由，法律规定法院可依职权裁定结案，而终本是为了探索执行实践中大量确实无财产可供执行案件的推出机制而创设出来的一种制度。