三年不在一起可以起诉离婚。根据《中华人民共和民法典》，夫妻一方要求离婚的，可以通过调解或直接向法院提起离婚诉讼。如果感情确已破裂，调解无效，法院可以在一次开庭后判决解除婚姻关系。分居几年并非离婚的必要条件，而是法院在审理时判断感情是否破裂的依据。法律分析；一、三年不在一起是否可以起诉离婚。1、三年不在一起是可以通过起诉离婚的。且若当事人起诉离婚的，人民法院经审理认为夫妻感情确已破裂的，调解无效的，可以在一次开庭之后判决双方解除婚姻关系。2、法律依据：《中华人民共和民法典》第一千零七十九条，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚。