军人分居补助的申请流程：当事人收集资料--到市房屋登记服务大厅购房补贴窗口申领--市房屋登记服务机构审核材料--购房补贴发放窗口发放补贴款。军人分居的情况国家会给发放一定标准的分居补助的，符合条件的可以向当地的房屋登记管理部门提出申请。军人分居补助申请的流程是怎样的？补贴领取程序：购房人应持相关手续到市房屋登记服务大厅，按照以下程序申领两地分居购房安家补贴。(1)购房人持身份证件、房证、结婚证、新户口簿、原户口簿、夫妻双方的社保证明或者个税缴纳证明等相关材料，到市房屋登记服务大厅购房补贴窗口申领补贴。(2)购房补贴审核窗口审查相关材料后，按照建筑面积计算补贴款，并向购房人发放《购房补贴领取凭证》。(3)购房补贴发放窗口依据领取凭证，向购房人发放补贴款。