工程合同应该注意以下问题。1、审查工程总价与付款条款的关系，注意是否有审计工程款的条款。2、工程合同涉及大量的合同附件，应注意与合同相关条款的一致性。3、竣工验收条款与付款条款密切相关，应注意竣工验收条款的审查，此外，竣工验收与交付、保修期有关。4、注意违约责任的约定，特别是工期延误，因工程质量问题无法验收时的违约责任。5、经过招标程序的，还需要检查相关招标文件是否与合同一致。【本文关联的相关法律依据】。《中华人民共和国民法典》。第七百八十 建设工程合同是承包人进行工程建设，发包人支付价款的合同。建设工程合同包括工程勘察、设计、施工合同。第七百八十九条 建设工程合同应当采用书面形式。