药店不允许使用医保卡购买避孕套。医保卡只能用于支付符合三大目录的医疗费用。购买避孕套可到便利店或商场，既能保证质量，也能有效避孕。避孕套的正确使用可降低感染艾滋病和淋病的概率，延长性交时间，减少不孕风险，防止精液过敏，提供安全保护，预防宫外孕和宫内感染。购买避孕套是一种安全有效的避孕措施。法律分析；药店买避孕套不可以刷医保卡。我国社保部门严格规定，医保定点零售药店不得向参保人员刷医保卡销售食品、化妆品、生活用品等物品。参保人员在定点医院发生的符合三大目录的相关医疗费用，医疗保险基金按照规定给予支付。