首先，在学历层次方面，肇庆学院是一所普通本科院校，主要提供本科学士学位课程；而肇庆医学院则是一所以医学为主要学科的本科院校，同样提供本科学士学位课程，但其专业设置更加偏向医学和相关领域。其次，在学科专业方面，肇庆学院开设了更广泛的学科专业，涵盖了文学、社会科学、工程、管理、艺术、外语等多个学科领域；而肇庆医学院则更加专注于医学及其相关专业，例如临床医学、口腔医学、预防医学、药学等。此外，两所学校在办学特色上也存在差异。肇庆学院注重培养学生的综合素质和实践能力，强调学科交叉与实践应用；而肇庆医学院则更侧重于培养医学领域的专业人才，注重医学实践、临床技能和医疗服务。