清洗水族箱过滤棉，应使用鱼缸中的原水或者是静置后的自来水。具体解释如下：为何使用鱼缸中的原水清洗过滤棉？因为清洗过滤棉时，若使用未经处理过的自来水直接冲洗，可能会给过滤系统带来新的微生物环境。直接使用鱼缸中的原水清洗可以更好地保护原本的微生物平衡。过滤棉本身的主要作用是过滤和稳定微生物环境，避免有害细菌的生长。因此，清洗时尽量避免破坏这种平衡。此外，使用静置后的自来水也是可以的，但最好避免使用含有大量氯或其他化学物质的自来水直接清洗，以防对过滤棉造成损害或影响水质。