申请人需根据不同的申请目的准备相应的材料。例如，赴就学、就业、培训等，需提交入境事务处出具的进入许可，赴澳门就学的，需提交澳门高等教育辅助办公室出具的《确认录取证明书》及澳门高等院校录取通知书。逗留签注有效期届满需继续申请逗留签注的，需提交相关批准文件。机关出入境管理部门只受理经本人提出的往来港澳通行证和签注申请。但有下列情形之一的，按照相应规定受理申请：已持有效往来港澳通行证委托他人代为申请签注的，委托人须出具委托书，申请人在港澳地区的不得委托他人代为申请；未满16周岁人员申请往来港澳通行证的，由监护人或者监护人委托他人陪同申请，申请人还应当提交《出生医学证明》或监护关系公证书，以及监护人的居民身份证。