结论是，初中阶段确实需要办理《预防接种证》。根据国家的《疫苗流通和预防接种管理条例》，该证件是儿童入托、入学时必须提供的必要文件。条例明确规定，托幼机构和学校在接收学生时，会进行预防接种证的查验，以确保孩子们按照国家免疫规划接种了相应的疫苗。对于未完成疫苗接种的儿童，学校需向相关疾病预防控制机构报告，并协助其监护人尽快补种。国家免疫规划由卫生主管部门制定，根据全国传染病流行情况和人群免疫状况等因素来确定疫苗种类。财政部门会参与决策，疫苗种类经批准后公布。省级在执行国家免疫规划时，可根据本地实际情况增加免费疫苗种类，但需报备案。