第二阶段审核则更加全面，是在第一阶段审核的基础上，依据ISO14001标准的全部要求，进行一次深入的审核。这一阶段着重检查管理体系是否能够有效运行，以及各项环境管理措施是否符合标准要求。第一阶段审核通常会进行文件评审和初步现场考察，以了解企业的环境管理体系状况，确定第二阶段审核的重点。而第二阶段审核则会涵盖管理体系的所有要素，包括环境因素识别、环境目标和指标、环境管理体系的实施和运行、管理评审和内部审核等，全面评估企业的环境管理体系是否符合标准要求。总的来说，第一阶段审核旨在确保企业具备了建立环境管理体系的基础条件，而第二阶段审核则是对企业环境管理体系进行全面、深入的检查，确保其能够有效运行，达到ISO14001标准的要求。