氧化磷酸化的机制复杂，抑制剂根据其作用机制可以分为三类：解偶联剂、磷酸化抑制剂和电子传递抑制剂。首先，解偶联剂，如2，4-二硝基苯酚，其功能在于保持氧化过程的正常运转，但阻断了ADP转化为ATP的过程，即分离了产能与储能的步骤，使得能量产生与储存脱节。其次，磷酸化抑制剂，如寡霉素，它直接作用于ATP合成酶，阻止ADP转化为ATP，同时抑制了ADP对氧利用的促进作用，从而影响了能量的生成过程。电子传递抑制剂则更为细致，主要包括。鱼藤酮等特定抑制剂，它们通过与NADH-CoQ还原酶中的铁硫蛋白结合，中断电子从NADH向CoQ的传递。抗霉素A等则干扰电子从细胞色素b到细胞色素c1的传递，影响电子链的连续性。