纪检部门对公务员超生二胎的处理政策已经有所调整。根据先前的规定，根据《行政机关工作人员处分条例》第三十三条，违规超生会面临降级或撤职的纪律处分，严重者甚至可能被开除。然而，随着我国对生育政策的最新变化，自2021年8月20日起，全国人大常委会通过的修正草案废除了对超生二胎的处罚，转而支持一对夫妻生育三个子女，以实现国家提倡的适龄婚育和优生优育目标。修正后的《人口与计划生育法》强调了国家对家庭生育、养育和教育的全方位支持，包括财政、税收、保险、教育、住房、就业等多方面的优惠政策，旨在减轻家庭在多子女抚养上的经济负担。这意味着，对于之前已经超生二胎的公务员，他们不再受到原有的处罚，而是遵循新的生育政策，享受国家的政策倾斜。