一、学位证书个数不同。全日制博士获得学位证和学历证书两本证书。在职博士只有没有证书一本证书。二、证书户口问题不同。在职博士并不想转户口，职博士教育正迎合了考生的初衷，考生在读博过程中，户口没有任何变化。全日制博士可以进行转户口处理。三、证书获取方式不同。由于单证博士免试入学、先读后考，所以无需备考。而双证博士，无论是否要脱离岗位，都需要经过统一的考试，对在职工作人员来说，在工作家庭之余抽出时间准备考试在时间方面肯定更加紧迫。四、证书获取费用不同。一般说来，各个学校的在职博士的培养经费都会高一些。全日制博士获取费用较低。五、上课方式不同；很多在职博士招生院校都采取集中授课的方式，考生不用全天在校学习，学习时间灵活成为这种教育方式的一大特色。全日制博士则需要全天在校学习。