首先，二者性质迥异，前者兼具行政及司法特性，后者则属司法范畴。其次，程序启动条件亦有所不同，劳动仲裁乃劳动争议诉讼之必经阶段，未经仲裁不得径行诉讼。再者，受理机构互异，前者由劳动争议仲裁委员会负责，后者则由民事审判庭接手。最后，审理期限存有区别，劳动仲裁庭裁定劳动争议案件，通常在仲裁委受理申请之日起45日内完成。而民事诉讼一审普通程序的审限规定为6个月。此外，法律效力亦不尽相同，劳动仲裁并非一裁终局，部分裁决仍可提起上诉。但劳动诉讼判决却具备最终决定力。