在4317千米的支流航线中，全年通航的河流仅有2294千米，占53.23%。不能全年通航的河流约1873千米，占43.39%。上游的支流中，汉江北岸的航运条件较差，而南岸的通航河流较多且较长，这些河流多穿越较为平缓的山地。但是，除了木马拦悉河、简尘乎月河滩险较少外，其他河流滩险仍然众多，船只载重有限，航行困难。中游通航支流较多，主要有唐白河、北河、南河、蛮河、利河、丰乐河、梓河等，其中唐白河航线最长，而北河、利河、丰乐河与梓河航线则非常短。下游支流上游多乱石，坡度大，不利于航行，中游多石滩，下游多泥沙沉积，也对航运造成妨碍。然而，在长江及汉江洪水倒灌至各河下游时，下游水位提升，且持续时间较长，因此夏季航运相对便利。