惠州南站坐落于惠州市惠阳区淡水新桥村爱民东路，是厦深高铁线上的重要站点。该站于2010年启动建设，并在2013年12月28日正式投入运营。惠东站于2012年破土动工，于同年12月28日竣工并开始运营。它位于惠州市惠东县稔山镇石井村，是杭深铁路厦深段的一部分。小金口站（惠州站）坐落于惠州大道与京九铁路之间，紧邻惠州火车站和小金口镇南部。乘客可在此换乘京九/广梅汕铁路。云山站（市站）位于云山西路与文明一路交汇处，邻近市民乐园、惠州市、市文化艺术中心、市科技馆、市博物馆、意生广场及佳兆业广场等。未来，这里将可换乘惠州轨道交通1号线。西湖东站（西湖站）位于环城西路丽日购物广场对面，靠近惠州西湖国家风景名胜区、惠州市中心医院、丰湖书院和步行街。