2000年的爆炸并非由融合过程引起，而是试图使用朗基努斯枪分离亚当的S2机关所致。传说中，谁能控制融合的过程，就能实现自己的愿望。例如，定远渡希望成为神并再次见到唯；而SEELE则希望所有人失去肉体，进行精神融合，实现真正的补完。当然，如果使徒实现了愿望，人类肯定会消失，因此必须进行保护。渚薰和绫波丽一样，只是灵魂的容器，被SEELE控制，注入了亚当的灵魂。最初认为可能存在平行世界的联系，但现在的看法是难以确定，可能需要等到最后一部才能明了。更多详细的解释可以在EVA吧的解惑贴中找到，那里聚集了许多才华横溢的大神。