与此同时，古代哲学的气、阴阳、五行等学说也被引入医学领域，作为方法论来阐释人体的生理和病理，指导疾病的诊断和防治。这些努力最终构建了中医学理论体系的基础。战国至秦汉时期被认为是中医学理论体系形成的黄金时期。这一时期出现的《黄帝内经》、《难经》、《伤寒杂病论》和《神农本草经》等医学经典著作，标志着中医学理论体系的确立。理、法、方、药体系在这些著作中得到了基本确立。这些著作不仅系统地总结了当时的医学知识，还为后世的医学研究提供了理论基础。