雅库茨克的年降水量仅239毫米，年平均气温为零下8摄氏度，这样的气候条件使得该市常年被多年连续永久冻土覆盖。为了应对这种特殊的地质结构，雅库茨克的建筑都建在坚如岩石的永久冻土上，即便在盛夏时节，也仅有一层1.2米厚的冻土能够融化，这使得建筑在夏季变得尤为脆弱。因此，木桩必须深深扎入活动土层之下，将房屋建在离地1米的桩上，以避免土地融化导致建筑物受损。雅库茨克的气温变化呈现出明显的季节性特征。冬季严寒而漫长，一月的平均气温为-38.6℃，而夏季则短暂而温暖，七月的平均气温升至19.5℃。这种极端的温差使得雅库茨克成为全球大陆性气候最典型的代表之一。有趣的是，尽管地表温度在零上35度或零下35度之间波动，但地下4米处的温度却常年保持在零下8度左右。